Οι Λογοθεραπευτές αναλαμβάνουν την περιοδική αξιολόγηση των μαθητών που παρουσιάζουν προβλήματα επικοινωνίας, λόγου, ομιλίας, φωνής (με ομιλία ή με εναλλακτικές μεθόδους). Προκειμένου στην καλύτερη αντιμετώπιση αυτών των προβλημάτων σχεδιάζουν και υλοποιούν προγράμματα αποκατάστασης. Επίσης υπάρχει η δυνατότητα συνεργασίας με τους γονείς, τους οποίους και καθοδηγούν πώς να χειρίζονται τα προβλήματα επικοινωνίας, λόγου, ομιλίας και  φωνής του παιδιού τους.

Στο ΕΕΕΕΚ Ιωαννίνων υπάρχει ξεχωριστή αίθουσα αποκλειστικά για τη Λογοθεραπεία η οποία εφαρμόζεται σε ατομική βάση και όταν κρίνεται απαραίτητο για τον ίδιο το μαθητή, σε συνεργασία με τον υπεύθυνο εκπαιδευτικό, μέσα στην τάξη.